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随着全电发票的普及，可以预见，全电时代基于“以数治税”的大背景下，对于税务机关来说，企业的各项经营数据将更透明化。因此，企业有必要从财税工作出发，提高自身的税务合规水平及意识。“工欲善其事，必先利其器”，企业应考虑优化如下各项管理流程，以降低其税务风险：
企业管理——全管理流程协同化
全电发票协同管理及财税一体化
全电票所涉及的各个环节，贯穿业务、财务、税务和电子档案各链条，这将推动企业布局合规、高效的业财税一体化管理体系，实现业财税的流转与数据交互和连接。
全电发票的入账归档要求
全电票作为电子会计凭证，根据相关规定[3]，一般而言，纳税人仅使用全电票电子件进行报销入账归档的，可以不再另以纸质形式保存。纳税人如果需要以全电票的纸质打印件作为报销入账归档依据，应当同时保存全电票电子档。
发票管理——强化合规风险管控
动态授信额度
全电发票取消了票面限额，推行“授信总额度管理”，这虽然为企业提供了便利度，但开票额度会根据纳税人税务合规情况进行动态调整，也就是说，如果企业一旦出现税务合规问题，开票额度就会受到影响。因此，企业应尤其注意规避不合规风险。
协同管理要求
发票的管理须从进、销两方面进行发票管理措施的协同升级，对外准确无误快速开具全电发票、对内企业收取全电票的内控管理（尤其在费用报销方面）也需更新，从而保障发票使用合规，避免潜在税务风险。
尤其对于大型企业及集团企业，其业务形态较多，机构组织复杂，发票的管理复杂度较高，需要极强的流程整合及系统支撑能力。
过渡期管理——应对过渡期的管理措施
目前，全电发票的受票试点工作已扩至全国所有省市。而全电票的开具也已经在10个省市试点，由此可见，在全国实现统一的开具和受票的全电票新时代即将开启，普通纸电发票也即将退出历史舞台。
开票端
在过渡期内，跨区域的企业尤其是分支机构多的大型企业，其运营区域可能处于不同的全电票试点阶段，涉及多种开票模式和系统，需要同时支持税控发票与全电票的自动化处理，这对企业的发票内控管理、风险管理的要求进一步提高。
受票端
过渡期内企业可能收到纸质发票、电子发票、全电发票等多种形式的发票，系统需要支持多种渠道采集并应该可以自动采集发票信息。同时，发票查询查验、勾选认证，需要在不同平台切换。因此，为了合规、合理地归集不同类型的发票，企业仍然需要优化不同发票的管理流程，与此同时积极部署进项系统升级方案，承接全电票的应用。
一言以蔽之，在全电票完全替代税控发票之前，企业仍然需要在过渡期同时做好开具、接受并管理普通纸电发票和全电票的工作，同时要提前布局信息系统的建立或升级，规避税务风险的发生。
